蛋白质-蛋白质相互作用在生物学中起着关键作用，但许多真核生物蛋白质复合物的结构尚不清楚，可能还有许多相互作用尚未确定。德克萨斯大学西南医学中心Qiang Cong以及David Baker等人利用蛋白质组范围内氨基酸协同进化分析和基于深度学习的结构建模的进展，系统地识别和构建酿酒酵母蛋白质组内核心真核蛋白复合物的精确模型。作者使用RoseTTAFold和AlphaFold的组合，通过配对多序列比对筛选830万对酵母蛋白质，确定1505对可能相互作用的酵母蛋白质，并为106个以前未确定的组件和806个尚未进行结构表征的组件建立结构模型。这些复合物具有多达5个亚单位，在真核细胞的几乎所有关键过程中发挥作用，并为生物功能提供了广泛的见解。该论文以“Computed structures of core eukaryotic protein complexes”为题发表在science上。